Die Präsident*innen und Rektor*innen der 21 Mitgliedshochschulen des GI NRW bilden die Trägerversammlung. Zur Trägerversammlung können bis zu drei Vertreter*innen von Universitäten sowie weitere Sachverständige aus Hochschulen oder Wissenschaftsorganisationen beratend hinzugezogen werden. Die Trägerversammlung wählt aus dem Kreis der Hochschullehrer*innen den Vorstand.

Der Vorstand bestellt eine Geschäftsführung in Einvernehmen mit der Sitz-Hochschule (Hochschule Bochum). Die Geschäftsführung unterstützt die Arbeit der Fachgruppen administrativ.

In den Fachgruppen des GI NRW forschen Professor*innen aus FH/HAW und Universitäten sowie Doktorand*innen zusammen zu interdisziplinären Themen.